Pedagoogilise kontrolli olemus seisneb selles, et koolijuht jälgib, kuivõrd ja kuidas täidab iga õpetaja aineprogrammi, milline on aine kasvatuslik toime ning missugused on õpilaste teadmised, oskused ja vilumused. Selliseks kontrolliks ei piisa ainult klassipäeviku sirvimisest ega sealsete hinnete arvestamisest. Hoopis konkreetsema pildi olukorrast annab õpilaste ja õpetaja koostegevuse süstemaatiline ning sihikindel vaatlus tunnis, sellele järgnev põhjalik analüüs ja õpilaste teadmisi ning oskusi fikseerivad kontrollküsimused või -tööd.