«Vaga vesi, sügav põhi» on pingeline lugu mineviku varjudest, armastusest, mida ei öelda välja, ja perest, mis ei sõltu verest. See on lugu kahest inimesest, kes ei taha tunnistada, kui lähedased nad tegelikult on – kuni pole enam võimalik teeselda.

Öös, kus vaikus katab räpaseid saladusi, valitseb Priit Saar – karismaatiline, kuid halastamatu narkoäri juht, kelle minevik varjab rohkem haavu, kui ta tunnistada suudab. Aastaid tagasi mõrvati ta poeg. Kuigi süüdlane leiti, nõudis see tõde veel ühe noore elu – Birgit Sooranna, kes püüdis omal käel poisi surma uurida. Tema noorem õde Maria jäi üksi. Ema kaotas ta vähile, isa suri enne ta sündi.

Saatuse keerdkäik viis Maria Priidu hoole alla. Tüdruk, kes oleks pidanud tema maailmast kaugel eemal olema, sai osaks sellest. Aastatega sai neist kummaline pere – ilma sõnadeta, ilma lubadusteta, aga tugevam kui kumbki tunnistada julgeks.

Nüüd, 17-aastaselt, tahab Maria teada, kes tappis tema õe. Teades, et Priit vaikib, asub ta tõde ise otsima. Ent mida sügavamale ta kaevub, seda rohkem hakkab ta sarnanema mehega, kelle varjus ta on kasvanud.

Samas kerkib allilmas uus, tundmatu vaenlane – keegi, kes tunneb Priidu süsteemi seestpoolt. Narkolaod hävivad, partnerid kaovad. Eesmärk on selge: Priit Saar tuleb hävitada.