Tõenäoliselt tunti Mer-Ka-Ba meditatsiooni juba Vana-Egiptuse müstilistes koolides. Tol ajal oli tegemist muidugi ülimalt salajase õpetusega, sest inimkond polnud veel küps nende teadmiste sügavust mõistma. Ka puudus siis planeeti ümbritsev Kristus-teadvuse võrgustik (see taastati alles aastaks 1989) ning Kristus-teadvusega ühinemine (mis on Mer-Ka-Ba meditatsiooni keskne osa) nõudis palju pikema-ajalist tööd iseendaga kui praegu ning oli jõukohane ainult väga väheste jaoks. Seevastu praegu, Uue Ajastu künnisel on see kõigile jõukohane, kes seda vähegi taotleb.
Mer-Ka-Ba meditatsioon koosneb neljast osast ning põhineb peamiselt hingamise, kujustamise ja käteasendite ehk mudrate kombineerimisel. Esimene osa on seotud oma isikliku energiasüsteemi puhastamisega, milleks kasutatakse lisaks hingamisele ja kujustamisele, veel silmapulssi (teatud kindlal viisil silmade liigutamist). Teine osa taastab sfäärilise hingamise. Kolmas osa on oma toimimiskeskme tõstmine südamesse ning ühinemine Kristus-teadvusega. Ning neljas osa aktiveerib valguseväljad meie ümber.
Mer-Ka-Ba meditatsiooni praktiseerimine toob endaga kaasa sügava vaimse kasvu, kuna ta tasakaalustab kõiki tšakraid ning sünkroniseerib ajupoolkerasid.
Ka Atlantise aegadel olid inimeste Mer-Ka-Ba’d aktiveeritud. Siis oli see loomulik seisund. Inimkond kaotas aga selle omaduse pärast Atlantise langust, mil hävis planeeti ümbritsev Kristus-teadvuse võrgustik.