Romaan on jätkuks 1959. aasta romaanivõistlusel premeeritud teosele «Lõokesed taeva all». «Üle allikate» viib lugeja jälle Vana-Võhma tehnikumi. Vahepeal on möödunud kaks aastat. Tuttavatest esimese kursuse õpilastest on saanud abituriendid. Vana-Võhmale jõuab tagasi aasta Moskvas õppinud Kõnnusaar ja taas puhkeb võitlus tema ning direktori kohusetäitja Lille vahel.
